1.Was mache ich mit meiner externen Festplatte? Die kann ich doch sicher jetzt nicht einfach anschließen...was ist wenn da auch Dateien infiziert sind?

Die kannst du anschließen, halte aber die Shift-Taste (die Taste mit dem Pfeil nach oben, mit der man Großbuchstaben produziert) gedrückt, während du das tust. Das deaktiviert den Autostart und dann sollte nichts mehr passieren. Nachdem das geschafft ist, kannst du die Platte mit dem Kaspersky Online Scanner überprüfen. Klicke dazu nicht mehr auf My Computer, sondern auf Folder, wähle die Platte aus, setze ein Häkchen bei Scan subfolders und klicke auf Scan. Falls etwas gefunden wird, kannst du es einfach manuell löschen.

2.Was mache ich mit den Programmen wie SUPERantiSpyware, GMER, CCleaner, Malwarebytes und HJT? Alle deinstallieren, oder vorsichtshalber behalten? Soll ich sie nutzen??

Superantispyware, Gmer und HJT können weg, Ccleaner und Malwarebytes könntest du behalten und ab und zu prophylaktisch einsetzen.

3. Könnte ich eine Empfehlung für ein vernünftiges Schutzprogramm erhalten? Avira alleine scheint ja nicht auszureichen.

Nein. Der gröbste Fehler besteht darin, sich auf sein Schutzprogramm zu verlassen. Avira ist vollkommen ausreichend, wenn man eine gewisse Vorsicht walten lässt und nicht alles anklickt, ausführt und herunterlädt, was bei drei nicht auf dem Baum ist. Außerdem sollte man sein System aktuell halten, das funktioniert wunderbar mit Secunia PSI. Alles noch genauer nachzulesen: Kompromittierung unvermeidbar? von Malte J. Wetz

Oh man, ich weiß gar nicht wie ich mich bedanken soll...wenn ich nicht wüsste, dass ich euch damit vermutlich nur mehr Arbeit machen würde, dann würde ich euch weiterempfehlen Ja und Dir würde ich Blumen schicken, wenn ich könnte...
Also recht herzlichen Dank

Gern geschehen