Scandisk? Du meinst chkdsk?
chkdsk sollte funktionieren. chkdsk geht ja nicht direkt auf eine verschlüsselte Partition rauf, sondern checkt das (von TC entschlüsselte) Dateisystem.

=> TrueCrypt - Free Open-Source On-The-Fly Disk Encryption Software for Windows 7/Vista/XP, Mac OS X and Linux - FAQ

Also findet Chkdsk immer nach der Entschlüsselung statt und nicht davor? Zuerst kommt TC Bootloader anschließend Windows 7 statt Win. 7 würde bei einer intensiven Prüfung nun Chkdsk ausgefürt nach der Entschlüsselung?

Ja erst kommt TC ins Spiel, dann bootet Win7 und macht chkdsk sofern chkdsk beim Booten ausgeführt wird (chkdsk /f geht ja nciht im laufenden Windows sondern nur beim nächsten Windows-Start)

Das ist gut dann besteht keine Gefahr das TC zerschossen wird beim Chkdsk.
Aber noch eine Frage zu der versteckten Partition. Jetzt wo das System komplett verschlüsselt ist jedoch die 11 GB nicht. Ich bin mir jetzt nicht ganz sicher wie eine Festplatte Daten speichert genau, besteht nicht die Gefahr das dort so was wie eine Lücke innerhalb der Verschlüsselung entsteht? Weil auch wenn es eine Partition ist, ist es immerhin noch das gleiche physikalische Laufwerk.

Nur um meinen Gedankengang näher zu beschreiben. Ich lösche zum Beispiel auf Partition C Daten und diese sind dann evtl. auf der 11 GB versteckten Partition wiederherstellbar z, B. durch eigene Datenumlagerung etc. Besteht diese Gefahr?

Ja, dieses Partition ist dann nicht verschlüsselt.

Nein. Was auf der C-Partition (verschlüsselt) ist, liegt nicht auf der leeren/versteckten Partition. Was du vom verschlüsselten C: löscht ist weg.

Wenn du nach der Entschlüsselung Daten von C auf die nicht verschlüsselte 11GB Partition kopierst, dann sind sie dort logischerweise nicht verschlüsselt. Aber von allein ist nichts auf der unverschlüsselten Partition.

Wie gesagt, wäre besser gewesen sich die Partitionen mal vorher genauer anzusehen. Ich weiß nicht was du mit diesem winzigen 11 GB Kuchstück nun anfangen willst. Sicher kannst du mit GParted diese Partition formatieren, aber diese ist dann unverschlüsselt. Müsstest dann wieder mit TC irgendwie ran. Container erstellen oder die gesamte Partition verschlüsseln.

Systempartitionsgröße verändern bzw. die 11 GB C: zuordnen geht ja so nicht mehr.

Könnte ich aber die 11 GB einfach einen sonstigen Laufwerkbuchstaben zuordnen mit Hilfe von PartedMagic ohne Gefahr zulaufen meine Bereits Verschlüsselte Partition zu zerschießen?

Ja natürlich geht das. Du kannst die 11GB einfach als unverschlüsselte Partition einrichten. Einfach mit GParted löschen, neu erstellen und formatieren. Sofern GParted diese Partitionsstruktur auch so erkennt wie sie unter Windows sich darstellt. Vllt machst du erstmal ein Screenshot von GParted damit ich weiß was da los ist.

Was du aber mit einem 11 GB Häppchen so sinnvoll anfangen willst ist mir nicht so wirklich klar.
Und für den Fall der Fälle wie zB Fehlbedienung bei GParted oder was auch immer solltest du trotzdem ein Vollbackup in der Tasche haben.

OK, ich denke das Risiko ist es nicht wert dann belasse ich es so, wie es ist. Da auch keine Lücke dadurch entsteht. Logischerweise sind diese 11 GB immerhin nicht verschlüsselt. GParted habe ich heruntergeladen aber es läuft nicht in meiner virtuelles Laufwerk, daher kann ich kein Screenshot machen.

Was meinst du da mit dem virtuellen Laufwerk?
Du hast von der Live-CD gebootet und welche Partitionsstruktur genau wird erkannt?